Sia Matrix sia XMPP sono standard aperti e federati per la messaggistica sovrana, ma si basano su filosofie architetturali differenti:
1. Matrix (Synapse, Conduit): modella le chat come un database distribuito replicato tra i server partecipanti (simile a Git). Vantaggi: sincronizzazione impeccabile della cronologia su più dispositivi, crittografia end-to-end (Olm/Megolm) nativa e supporto multimediale moderno, a fronte di un consumo di RAM e storage del server più elevato.
2. XMPP (Jabber, ejabberd, Prosody): protocollo client-server leggerissimo a scambio di messaggi XML. Con l'estensione OMEMO garantisce crittografia E2EE avanzata con consumo di risorse minimo, ideale per server embedded o flotte con decine di migliaia di utenti simultanei.